漁翁島燈塔展示館位於漁翁島燈塔園區內，入口右側第一棟建築物，目前設有一位管理員，是隸屬於財政部關稅總局。展示館為一簡單的展示室，主要是陳列燈塔一些舊器具，以及有關於台灣地區所有燈塔的照片，另外還展示郵局曾經發行過的郵片，並介紹有關關稅總局相關航線、海關管理說明文件，最有特色的還是漁翁島燈塔全景模型及燈塔縮小模型。展示館是隨著燈塔開放參觀而設立，供遊客參觀燈塔時，能順便了解燈塔的由來及各項設施，採自由參觀，無須門票。

漁翁島燈塔展示館內主要成列漁翁島燈塔全景模型以及主燈模型，另外也陳列燈塔各種設備，包括閃光機、現用燈泡、氧化管、白熱燈等等。