二崁博物館位於西嶼鄉二崁村內，陳家古厝的北側，民國90年8月設立開館，由二崁村聚落協進會所規劃成立。博物館主要是以二崁傳統民宅為展示館，進入博物館內就如同進如當地的傳統民宅參觀；館內主要展出當地居民傳統文物，以及廟宇的文物，具有西嶼鄉當地民俗特色。除了參觀博物館外，同時也能參觀附近的二崁童玩館、潮間帶展示館、陳宅古厝、萬國畫石牆、陳氏宗祠等。目前參觀二崁博物館需事先向二崁聚落協進會預約時間才能參觀。

二崁博物館主要是典藏當地的常民文物，生活用具和寺廟的舊文物，較具獨特的是，二面白虎旗及一面青龍旗，是一百多年前手工繪製，二興宮驅除瘟疫之鎮煞物；西嶼鄉特有的萬字笠、二興宮香爐、二崁公陀、竹箱及扁擔、三寸金蓮、電土燈、南管樂器，許多常民使用的器具、器皿、生活用品等等。