西嶼鄉的畜牧以黃牛最多，其次是山羊，近年來引進梅花鹿的飼養，產量也逐漸增多。黃牛約佔九成以上，專供農耕地之翻耕及駕牛車之用，然近年政府鼓勵農民飼養肉牛，並獎助興建牛舍等設施，及改良耕牛品種。西嶼鄉以飼養努比亞改良種山羊為主，多數是成群結隊放牧，以在「冬至」前後價格最高，尤以黑毛色土山羊更是爭相搶購。西嶼鄉主要畜牧的地方包括，竹灣牧場、二崁草原、大池村北港西北側、外垵高地上的草原。